Το κτήριο, το οποίο σχεδιάστηκε από τον αρχιτέκτονα Μ. Botta, αποτελείται από ισόγειο και πέντε ορόφους συνολικής επιφάνειας 6.500 m2, καθώς και τέσσερα υπόγεια επίπεδα που εκτείνονται κάτω από τις αρχαιότητες της Αχαρναϊκής οδού.

Οι αρχαιότητες εκτίθενται σε ημιυπαίθριο χώρο.